L’IGD, l’IEPI et l’IDHEAP sont les partenaires institutionnels historiques de l’Observatoire.
Cependant, l’Observatoire est une structure ouverte à la multiplicité des partenariats (ADEME, CREM, SUDEN, FSU, APERAU, etc.). Ces partenariats peuvent être de plusieurs types : scientifiques, techniques, financiers. Ils peuvent se dessiner sur plusieurs temporalités.