Le CIHSR appuie de diverses façons et diffuse les activités de recherche en histoire et sciences des religions à l'UNIL.
Il promeut tout d’abord la rencontre et la collaboration de chercheurs et enseignants issus d’horizons disciplinaires et méthodologiques différents, travaillant autour des phénomènes religieux (au sens large de ce terme), phénomènes envisagés en tant que productions culturelles de nature symbolique de l'homme vivant en société.
Il offre ensuite un soutien structurel et financier permettant l'organisation des événements scientifiques liés à l'histoire et aux sciences des religions, l'invitation d'intervenants extérieurs, ou la participation des membres du CIHSR à des colloques et des congrès.
Il offre également une aide financière ponctuelle à la réalisation de recherches de terrain des chercheurs rattachés à sa structure.
Enfin, le CIHSR fournit un soutien logistique, publicitaire et financier aux conférences et colloques ainsi qu'aux publications portant sur le domaine religieux.
