L’École de médecine a été pionnière en Suisse dans la mise sur pied dès 1990 d’échanges internationaux notamment dans le cadre de la mobilité Erasmus, appelée aujourd’hui mobilité SEMP (Swiss Exchange Mobility Programme). Elle a conclu des accords d’échange avec une quarantaine de facultés européennes dont notamment l’Allemagne, le Royaume Uni, l’Espagne, les pays scandinaves et l’Italie. Ces accords permettent le transfert de crédits ECTS, nécessaires à la validation de l’année académique pour l’étudiant·e en mobilité.
Ce programme d’échange rencontre un vif succès, puisque près d’un tiers des étudiant·e·s de 1re année de Master de l’École de médecine participent à ce programme d’échanges pour un séjour de 1 ou 2 semestres (Mobilité OUT) dans l’une des Facultés de médecine partenaires (en Suisse ou en Europe) de l'École de médecine. En contrepartie, cette dernière accueille des étudiant·e·s des universités partenaires pour suivre des cours ou des stages pratiques (Mobilité IN), montrant ainsi l’attractivité de son curriculum de médecine auprès des universités européennes.