Anna-Sapfo Malaspinas

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Version du 18 mai 2017, mise à jour le 27 novembre 2023

Anna-Sapfo Malaspinas, professeure associée

Spécialiste en biologie computationnelle et évolutive, Anna-Sapfo Malaspinas s’intéresse tout particulièrement à la génétique des populations, notamment à partir de l’analyse de l’ADN ancien¹. Elle a été nommée professeure associée au Département de biologie computationnelle de l’UNIL dès le 1^er octobre 2023.

Les travaux de recherche d’Anna-Sapfo Malaspinas se focalisent sur des questions de génétique théorique des populations, et en particulier sur l’analyse de l’ADN ancien. L’approche de la scientifique combine le développement d’outils computationnels innovants et de nouvelles théories évolutives avec l’analyse de données à grande échelle. Un de ses axes de recherche consiste à mieux comprendre comment les humains ont colonisé le monde et se sont adaptés aux nouveaux environnements qu’ils rencontraient. Un grand nombre de méthodes existent actuellement pour caractériser l’évolution des populations, mais plutôt à partir d’échantillons d’ADN contemporain. La professeure développe de nouveaux outils et modèles mathématiques et computationnels applicables à l’ADN ancien. Grâce à ceux-ci, elle vise à caractériser le peuplement de plusieurs régions du monde telles que les Andes, la Polynésie et la Grèce, ou encore à déceler la présence de microbes dans des restes humains à travers le temps. À partir de données anciennes et actuelles issues du génome de ces populations et grâce à des méthodes statistiques innovantes, Anna-Sapfo Malaspinas a pour objectif de déterminer, par exemple, le moment et le lieu du premier contact entre la Polynésie et les Amériques, d’investiguer si des changements de cultures sont accompagnés de flux de gènes massifs, ou encore de chercher des agents pathogènes qui auraient infecté des populations anciennes. Ses travaux de recherche bénéficient non seulement au domaine relativement jeune que constitue l’analyse des génomes anciens, mais aussi à la biologie évolutive en général.

L’expertise d’Anna-Sapfo Malaspinas est reconnue au niveau international et a déjà été récompensée, entre autres, par plusieurs financements du Fonds national suisse pour la recherche scientifique (FNS) et par une bourse ERC Starting Grant obtenue en 2016. La scientifique a publié une quarantaine articles dans des revues scientifiques de référence, telles que Plos Biology (2007), Theoretical Population Biology (2011), Genetics (2012), Science (2010), PNAS (2014), Current Biology (deux publications en 2014), Nature (2016), Science (2018), Bioinformatics (2020) et Cell (2021). Elle est par ailleurs très impliquée dans l’enseignement pré- et post-gradué et a supervisé plusieurs étudiant·e·s en Master et en doctorat. Anna-Sapfo Malaspinas a également coordonné, conceptualisé et dirigé un projet multidisciplinaire de communication scientifique basé sur ses travaux de recherche. Baptisé Génome Odyssée, celui-ci évoque la sortie d’Afrique des premiers êtres humains modernes, en direction de l’Australie. Il a notamment abouti à la création d’un spectacle qui a été joué au Musée d’ethnographie de Genève et au Musée de l’Homme, à Paris.

¹ADN ancien: ADN dégradé, disponible en petite quantité et donc difficile à extraire. L’ADN ancien peut être prélevé sur des fossiles (par exemple des restes humains) datant de plusieurs milliers d’années ou beaucoup plus récents. À l’inverse, l’ADN moderne n’est pas aussi endommagé puisqu’il n’est par exemple pas attaqué par des enzymes post-mortem.

Bio express

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